Efikasno upravljanje zaštićenim područjima i podacima o biodiverzitetu su ključni izazovi za nacionalno, regionalno i na kraju globalno očuvanje biodiverziteta. Stalne prijetnje, koje kontinuirano vrše pritisak na ograničene resurse koji su na raspolaganju, predstavljaju otežavajuću okolnost za upravljanje zaštićenim područjima i praćenje biodiverziteta, što bi na kraju moglo narušiti integritet zaštićenog područja na lokalnom, nacionalnom i prekograničnom nivou i sistem očuvanja prirode u cjelini. Potrebno je hitno poboljšati upravljačke kapacitete zaštićenih područja na svim nivoima. Administrativne jedinice koje upravljaju zaštićenim područjima treba da imaju planove i prioritete za razvoj kapaciteta, kao i planove upravljanja i monitoring protokole u skladu sa EU standardima i zahtjevima. Jačanje kapaciteta je neophodno za moderno planiranje, praćenje i izveštavanje o stanju biodiverziteta u zaštićenim područjima, kako za uprave zaštićenih područja tako i za državne institucije, u cilju sprovođenja monitoringa na odgovarajući način.